Решение о создании Новосибирской региональной общественной организации «Союз православных педагогов Новосибирской области» было принято 17 марта 2012 года. Тогда же состоялось Учредительное собрание на котором был избран председатель организации – профессор Леонид Григорьевич Панин, доктор филологических наук, заведующий кафедрой древних языков, декан гуманитарного факультета Новосибирского Государственного университета.
Зарегистрирована организация 30 ноября 2012 года.